微生物肥料是含有活微生物的特定制品，目前可分為兩類：一類是狹義的微生物肥料，應用于植物生產取得特定的肥料效應，增進植株生長，在這種效應的產生中，制品中活微生物的生命活動起關鍵作用；另一類則是廣義的微生物肥料，是指通過其中的微生物的生命活動，不但能提高植物營養元素的供應量，還能產生如植物生長 等次生代謝物質，增進植物對營養元素的吸收利用或有拮抗某些病原微生物的致病作用，減輕農作物病蟲害而增進作物產量的增加。下面，請隨許昌益稼人一起來揭開微生物世界的面紗，我們需要深入了解她，因為微生物肥料因其應用范圍廣泛、生產成本低廉、減少環境污染，在果樹生產中越來越受重視。
　　果樹中常見的微生物肥料的種類很多，按其作用機理及對植株生長的影響可分為固氮菌肥料、解磷菌類肥料、解鉀菌類肥料、抗生菌類肥料、復合菌類肥料等。
　　1.固氮菌肥料
　　固氮菌肥料是利用固氮微生物將大氣中的氮氣轉化為農作物能利用的氨，增加土壤中的氮素含量，為蛋白質的合成提供所必要的氮素營養，進而增進植物生長的肥料。生物固氮在常溫常壓條件下便可進行，是實惠、干凈、效能高率的施肥過程。固氮菌肥料也成為理想的、有發展前途的肥料。
　　2.解磷菌類肥料
　　解磷菌類肥料是一類能夠將植物難以吸收的磷轉化為可利用狀態的肥料，這類肥料除了可以增強土壤中難溶性磷的活躍度外，還可以通過影響植物根系分泌物的種類和數量，以增加植物根系對周圍鉀、鈣、鎂、鐵、鋅等營養元素的吸收，使植物能夠適應鹽、堿、缺磷等惡劣的環境。
　　3.解鉀菌類肥料
　　解鉀菌類肥料是硅酸鹽微生物菌劑為主，作為植物根際的促生菌，能夠分化不溶的硅酸鹽和鋁硅酸鹽組成的無機礦物，釋放鉀、磷、硅等元素，增加土壤中效能高的養分含量；增進作物生長發育，提高產量。
　　4.抗生菌類肥料
　　抗生菌肥料是指能分泌 素和 的微生物制成的微生物肥料制品。其菌種通常是放線菌，我國應用多年的“5406”即屬此類。 素能夠與病原菌競爭營養物質、破壞病原菌的細胞壁，從而抵抗了某些病原菌的合成與繁殖，對作物生長有防病保苗作用；而 能夠分泌吲哚乙酸、細胞分化素、赤霉素等植物生長調節物質，則能增進作物生根、發芽和早熟。
　　5.復合微生物肥料
　　復合微生物肥料是指兩種或兩種以上的微生物，或一種微生物與其他營養物質復配而成的肥料，能提供、保持或優化植物營養，提高農產品產量或優化農產品品質的活體微生物制品，可做基肥，在果樹生產上的應用較廣。